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基于高通量测序的基因组分析


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基于高通量测序的基因组分析
  • 书号：9787030721488
    作者：王峥峰
  • 外文书名：
  • 装帧：平装
    开本：B5
  • 页数：
    字数：202000
    语种：zh-Hans
  • 出版社：科学出版社
    出版时间：2022-06-01
  • 所属分类：
  • 定价： ￥108.00元
    售价： ￥85.32元
  • 图书介质:
    纸质书

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高通量测序已成为生物学研究的重要手段，在生物多样性、物种种质资源开发利用和生物医药领域都发挥了非常重要的作用，因此，如何处理和分析高通量测序数据成为生物学研究的必备技能之一。本书以高通量测序数据在基因组分析中的运用为例，采用分步讲解的方式，图文并茂地介绍了高通量测序数据的基本格式，利用高通量测序数据开展分析的流程、相关程序，程序执行过程及其分析注意事项。同时，对于数据分析运算中的一些中间结果，作者提供了自己编写的程序，以利于获得最终结果。书中提供了Linux操作系统安装方法，并基于Linux语言命令介绍了高通量测序数据处理过程，其中没有复杂的程序代码，不需要编程语言基础，浅显易懂，具有很强的实践操作性。
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    第一章　Linux系统安装　1
    第二章　Linux基本命令　6
    第三章　高通量测序数据的常见格式　12
    第四章　基因组组装　15
    第一节　基因组大小估测 　15
    第二节　基于PacBio HiFi模式测序数据的基因组组装　21
    第三节　基于PacBio CLR模式测序数据的基因组组装　27
    第四节　基于Nanopore测序数据的基因组组装　30
    第五节　去除基因组中的冗余序列　37
    第六节　Hi-C组装　47
    第五章　重复序列查找　66
    第六章　基因预测　72
    第七章　基因家族扩张和收缩 　82
    第八章　物种历史动态　100
    第九章　群体重测序个体的SNP查找　110
    第十章　遗传多样性参数计算　124
    第十一章　受选择作用的SNP位点　129
    第一节　PCAdapt分析　129
    第二节　BayPass分析　135
    第三节　合并PCAdapt和BayPass结果　140
    第十二章　遗传结构分析　144
    第一节　PCA分析　144
    第二节　Admixture分析　146
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