随着基因组研究技术的迅猛发展，我们已经积累了海量的基因组数据，而且未来还会产生更为庞大的基因组数据。如何解读这些海量数据，理解生命的相关本质，成了这一后基因组学时代的一个巨大挑战。基于比较方法的进化基因组学研究无疑将成为解读这些海量数据的一个十分有效的手段。但是，有关基因组进化研究的历史、现状和未来一直都缺乏一个完整的描述，有关其研究内容也十分模糊。
本书通过邀请一批相关领域的著名学者，包括美国科学院院士Margaret Kidwell和亚利桑那大学分子进化学家SudhirKumar等著名科学家，首次全貌式地介绍了基因组进化研究的各个方向和领域。内容涉及基因组组成、结构及其进化，基因组进化与一些重要生物学问题的关系，以及通过比较基因组学研究理解基因组结构和功能进化的型式和机制等。
作者设计该书时，充分考虑了对基因组进化研究的全景介绍，对历史和基本概念的介绍和梳理，以及对每个领域各时期文献的综述和列举，并在每一章后面都做了小结和相关领域的展望。这样的处理使得全书比较通俗易懂，只要具备基本的生物学和遗传学知识就可以读懂。
这是一本特别适合那些想了解或进入进化基因组学领域的研究生和博士后的书。但同时对于基因组学领域的专业研究人员和科学家也会是一本很好的参考书。
样章试读
目录
- 第一部分C值之谜
第一章动物基因组大小的进化
T. Ryan Gregory
为什么要关注基因组大小？
动物基因组大小：历史回顾
动物基因组的知识现状
变异的型式
动物的种内变异
基因组大小改变的机制
动物基因组大小进化方向的探索
基因组大小和细胞
基因组大小和生物的形态
动物基因组大小的测量
小结和展望
第二章植物基因组大小的进化
Michael D. Bennett和Ilia J. Leitch
植物基因组大小研究简史
关于植物基因组大小的已有知识现状
植物基因组大小进化的型式
植物基因组大小怎样进化？
植物中与基因组大小相关的因素
基因组大小变异的生态学和进化意义
基因组大小的种内变异
估计植物基因组大小的方法
小结和展望
第二部分基因组寄生物的进化
第三章转座子
Margaret Kidwell
转座子研究简史
谁在意转座子？
转座子的分类
转座子的特征
鉴别和研究转座子的方法
转座子在生物学其他领域的应用
转座子普遍存在于真核基因组中
转座子在基因组中的分布
转座子进化的动力学
转座子活性的调控
作为突变源和基因组变异源的转座子
小结和展望
第四章B染色体
Juan Pedro M. Camacho
B染色体研究简史
B染色体侵染的频率
B染色体生物学
B染色体的起源
与宿主基因组的相互作用
与宿主的相互作用
B染色体进化动力学
小结和展望
第三部分重复、重复
第五章小规模重复
John S. Taylor和Jeron Raes
基因重复研究的悠久历史
基因重复的机制
重复基因在基因组中的生存和死亡
重复基因会发生什么变化？
Hox基因重复和动物发育的进化
基因重复的普遍进化意义
小结和展望
第六章大规模基因重复和古老的基因组重复
Yves Van de Peer和Axel Meyer
大规模重复重要性的历史回顾
大规模重复的机制
如何研究大规模基因重复
重复事件时间的推算
理论与实践的结合：大规模基因重复的证据
进化过程中的大规模重复
物种形成和分化(divergent resolution)
小结和展望
第四部分更多重复
第七章植物中的多倍体
Jennifer A. Tate, Douglas E. Soltis和Pamela S. Soltis
植物多倍体研究历史
多倍体的类型
多倍体的频率
多倍体的形成和建立
多倍体物种的多次起源
多倍化在细胞和植物体水平的影响
多倍化在基因组水平的影响
小结和展望
第八章动物多倍体
T. Ryan Gregory和Barbara K. Mable
多倍体动物的起源和分类
鉴别多倍体
为什么动物多倍体比植物少？
多倍体与单性形式
脊椎动物中的多倍体
无颌鱼类
软骨鱼类
肺鱼
软骨硬鳞鱼
硬骨鱼
两栖类
爬行类
哺乳动物和鸟类
脊椎动物多倍体总结
无脊椎动物中的多倍体
甲壳类
昆虫
软体动物
环节动物
扁虫类
其他无脊椎动物
无脊椎动物多倍体及其地理分布
多倍体的进化命运
小结和展望
第五部分序列和结构
第九章真核细胞的比较基因组学
Allan Filipski和Sudhir Kumar
比较真核基因组学的早期历史
真核基因组的研究
大规模真核测序计划的诞生
真菌的基因组测序
秀丽线虫和黑腹果蝇：第一批被测序的动物
人类基因组计划
小鼠和大鼠基因组：现代哺乳动物比较基因组的兴起
植物及其病原菌的基因组测序
其他无脊椎动物基因组
脊椎动物中的全基因组重复？
原生动物基因组
比较基因组学和真核生物的系统发生
小结和展望
第十章原核生物的比较基因组学
T. Ryan Gregory和Rob Desalle
什么是原核生物？
原核生物基因组测序的兴起
关于原核基因组的基本认识
遗传物质的水平转移
原核生物基因组测序计划重要事件
原核生物基因组大小的进化
最小基因组概念
关于原核生物丰度和多样性的基因组学认识
原核基因组学的应用
小结和展望
第六部分进化中的基因组
第十一章宏进化和基因组
T. Ryan Gregory
一、宏进化理论和基因组进化
进化理论简史
宏进化理论有必要吗？
宏进化理论的结构
基因组的宏进化观
二、“非标准的”基因组进程和大的进化转变
基因组和细胞的起源
性别的进化
真核细胞的起源
多细胞的起源和复杂后口动物的出现
免疫的进化
脊椎动物的起源
人类的特殊性
小结和展望
基因组和未来的生物学
索引
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