双链RNA可抑制含有特定序列的基因表达,即RNA干扰的发现开创了一个新的生命科学研究领域,目前这个研究领域正在快速发展之中。书中对RNA干扰的理论系统、技术体系及应用研究进行整体的构思,以该领域最新的研究成果为基础,除了双链RNA干扰之外,重点突出了对新发现的微小RNA(miRNA)进展的描述,从而全面系统地描述了RNA干扰;结合作者实验中的研究经验,系统地介绍了当今RNA干扰在多种生物体系中研究的实用技术方法。
本书适合生物学、医学及相关领域的实验人员、研究生等使用。
样章试读
目录
- 序言
前言
第1部分 RNA干扰理论
1 RNA干扰的发展历史与意义
1.1 RNAi的发现
1.2 RNAi的意义
2 微小RNA概述
2.1 miRNA的发现过程
2.2 miRNA的生物学特征
2.3 miRNA的基因组学
2.4 miRNA的成熟及效应过程
2.5 miRNA的功能
2.6 展望
3 依赖于RNA的RNA聚合酶
3.1 RdRP在基因沉默中作用的发现及相关证据
3.2 RdRP的生化物理性质及其晶体结构
3.3 RdRP与RNA病毒
3.4 RdRP和RNA沉默
3.5 降级性PCR、过渡性RNAi及系统性RNAi
3.6 RdRP作用过程中的问题
4 微处理器
4.1 微处理器的相关蛋白成分及其对miRNA的加工
4.2 pre-miRNA从细胞核输出的过程
5 干扰性小RNA产生的关键性蛋白——Dicer
5.1 DCR的发现背景
5.2 DCR的一般生化属性及相关生物学功能
5.3 DCR的作用方式及在不同生物体中的作用
5.4 DCR作用的底物——dsRNA及pre?miRNA的特征及来源
5.5 DCR的加工产物——siRNA和miRNA
5.6 不同生物体中DCR的同源物及其基因
6 RNA诱导的沉默复合体
6.1 RISC的发现背景
6.2 参与RISC组装的小RNA分子及其可能的组装模式
6.3 RISC的主要成分——AGO蛋白
6.4 RISC在果蝇体内的组装模型
6.5 RNAi的剪切模型
6.6 RISC指导的靶向性剪切的动力学研究
6.7 参与RISC组装及效应过程的相关蛋白质及影响因子
6.8 RISC的功能
6.9 小结与展望
7 细胞核内的RNA干扰途径
7.1 RNA指导的DNA甲基化
7.2 RNAi和异染色质的形成
7.3 RNAi和DNA切除
7.4 减数分裂性沉默、配对和RNAi
7.5 细胞核内RNAi途径的作用方式
7.6 其他生物体中的相关机制
第2部分 RNA干扰技术原理与方法
8 siRNA或dsRNA的设计与筛选策略
8.1 重组质粒方法筛选siRNA
8.2 高通量筛选siRNA的微阵列方法
9 化学方法合成siRNA
9.1 2′-tBDMS方法
9.2 2′-TOM方法
9.3 2′-ACE方法
10 siRNA的体外转录及生物合成方法
10.1 PCR siRNA合成法
10.2 T7 RNA聚合酶转录法
10.3 应用重组人Dicer体外合成siRNA
11 基因工程方法制备siRNA
11.1 表达元件的构建
11.2 载体构建
12 siRNA的实验技术方法
12.1 siRNA的体外合成及转染方法
12.2 体外转录制备dsRNA
12.3 基因工程方法制备siRNA及转染细胞的方法
12.4 RNAi在其他生物体中的应用研究方法
13 miRNA的实验技术方法
13.1 miRNA的提取
13.2 miRNA克隆
13.3 miRNA分子杂交检测技术——Northern印迹
第3部分 RNA干扰的应用研究
14 RNA干扰在研究基因组功能方面的应用
14.1 动植物中的RNAi
14.2 RNAi在线虫全基因组功能研究中的应用
14.3 RNAi在果蝇研究方面的应用
14.4 RNAi技术在锥虫研究中的应用
14.5 PTGS在植物基因及基因组功能方面的研究
15 RNA干扰在研究胚胎发育方面的应用
15.1 RNAi在小鼠卵母细胞和胚胎中的应用
15.2 RNAi在鸟类胚胎发育中的研究
16 RNA干扰在抗病毒研究中的应用
16.1 RNAi抗HIV?1病毒感染
16.2 RNAi抗禽类逆转录病毒感染
16.3 RNAi抗肝炎病毒感染
16.4 RNAi抗流感病毒感染
16.5 RNAi抗SARS相关冠状病毒感染
16.6 RNAi抗轮状病毒感染
17 RNA干扰在肿瘤研究中的应用
17.1 目前常用的肿瘤相关基因功能的研究方法
17.2 RNAi在肿瘤生物学中的应用
17.3 RNAi在基因治疗中遇到的主要问题
18 RNA干扰在其他领域的治疗研究
18.1 RNAi在心血管疾病中的应用研究
18.2 RNAi在神经系统疾病中的应用研究
18.3 RNAi在内分泌系统疾病中的研究进展
18.4 RNAi在自身免疫性疾病中的应用研究
18.5 RNAi在生物学和医学中的应用前景
索引