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  药物设计中的分子...
  ￥16.59元

本书为《计算机化学化工丛书》之一。
本书以小分子的化学结构信息处理为核心，介绍药物设计中的分子模型化方法。全书分为九章：前三章为第一部分，是一些通用的方法、原理和技术，分别介绍分子结构的计算机处理、分子的相互作用、分子结构信息数据库；后六章为第二部分，分别介绍人工智能中的遗传算法，定量结构活性关系（QSAR）研究、结构匹配和数据库搜索技术、虚拟受体模型方法、药物与受体的对接技术和模拟肽学等六个专题。
本书是一本面向应用、介绍计算机辅助药物分子设计方法的入门书，适合从事计算机化学的研究人员及从事新医药、新农药研制与开发的研究人员阅读和参考，也可供化学各专业大学生及研究生阅读。本书有助于读者了解计算机处理化学信息的基本方法和用于分子设计的各种实用技术。

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• 《计算机化学化工丛书》序
  前言
  第一章分子结构的计算机处理
  1.1分子结构信息的表达
  1.1.1化合物的命名
  1.1.2碎片码、线形码、拓扑码
  1.1.3连接表
  1.2分子结构的输入
  1.3分子结构的几何优化
  1.3.1分子力学方法
  1.3.2量子力学方法
  1.3.3优化算法
  1.4构象分析
  1.4.1系统搜索方法
  1.4.2Monte Carlo方法
  1.4.3模拟退火算法
  1.4.4遗传算法
  1.4.5分子动力学方法
  参考文献
  第二章分子的相互作用
  2.1范德华相互作用
  2.2静电相互作用
  2.2.1计算原子点电荷的方法
  2.2.2分子的静电势
  2.3氢键相互作用
  2.4疏水相互作用
  2.4.1疏水效应和疏水作用
  2.4.2分配系数
  2.4.3疏水场
  2.5分子相互作用场的开发
  参考文献
  第三章分子结构信息数据库
  3.1结构数据库的三维信息来源
  3.1.1三维结构的实验来源
  3.1.2三维结构的计算来源
  3.2基于实验数据的结构数据库
  3.2.1蛋白质结构数据库PDB
  3.2.2有机小分子结构数据库CSD
  3.2.3无机晶体结构数据库ICSD
  3.3基于计算结果的结构数据库
  3.4中药成分结构及生物活性数据库
  3.4.1需求分析
  3.4.2结构信息的计算机化
  3.4.3中药英文信息的规范化
  3.4.4研究进展
  3.5小结
  参考文献
  第四章遗传算法
  4.1遗传算法
  4.1.1遗传算法的表达式
  4.1.2遗传算法常用算子
  4.1.3遗传算法的其他参数及步骤
  4.1.4遗传算法的数学原理
  4.2经典遗传算法示例
  4.2.1寝试群体的产生
  4.2.2复制
  4.2.3杂交
  4.2.4变异
  4.3有指导性的遗传算法DGA
  4.3.1寝群体的产生
  4.3.2线杂交
  4.3.3面变异
  4.3.4线杂交和面变异的联合作用
  4.3.5排序
  4.3.6群体规模
  4.3.7停止判据
  4.3.8DGA的步骤
  4.3.9对DGA在优化中的测试
  参考文献
  第五章定量结构活性关系研究
  5.1用于QSAR的生物活性数据
  5.2用于QSAR的分子结构参数
  5.2.1电性参数
  5.2.2立体参数
  5.2.3疏水参数
  5.3经典QSAR模型
  5.3.1hansch模型
  5.3.2Free?Wilson模型
  5.3.3其他模型
  5.3.4QSAR模型的评价
  5.4CASAC软件
  5.4.1设计思想
  5.4.2结构框架模型
  5.4.3结构信息数值化子系统NumSF
  5.4.4数据分析及预测子系统AnaQS
  5.4.5研究实例
  5.5用遗传算法挑选变量
  5.6经典QSAR的成功实例
  5.6.1治偏头痛新药lomerizine
  5.6.2杀真菌农药metconazole和ipconazole
  5.6.3治风湿性关节炎新药flobufen
  5.7场分析方法CoMFA
  5.8本征值方法EVA
  5.9偏最小二乘回归
  5.10小结
  参考文献
  第六章结构匹配和数据库搜索技术
  6.1子结果匹配算法
  6.1.1回溯法
  6.1.2划分?松驰法
  6.1.3筛分法
  6.1.4其他方法
  6.2最大共同子结构查找算法
  6.2.1 Brown算法
  6.2.2 EMCSS算法
  6.3药效团识别
  6.4三维结构数据库搜索技术——3DFS系统
  6.4.1提问结构定义
  6.4.2搜索算法
  6.4.3搜索例子
  6.5小结
  参考文献
  第七章受体模型
  7.1受体模型概述
  7.2基于形状的受体模型
  7.2.1建模思想
  7.2.2建模步骤
  7.2.3应用实例
  7.3基于虚拟原子的受体模型
  7.3.1建模思想
  7.3.2方法原理
  7.3.3应用实例
  7.4基于虚拟点表面的受体模型
  7.4.1概述
  7.4.2虚拟受体表面的产生
  7.4.3表面性质的计算
  7.4.4配体分子与受体表面模型的相互作用
  7.4.5配体分子内能量的计算
  7.4.6应用实例
  7.5小结
  参考文献
  第八章药物与受体的对接技术
  8.1基于受体结构的药物设计
  8.2已知配体对接
  8.2.1已知结合位点的实时图形对接
  8.2.2自动对接
  参考文献
  第九章模拟肽学
  9.1模拟肽学概述
  9.1.1生物活性肽作为药物的局限性
  9.1.2模拟肽学中的两类方法
  9.2以肽主链为基础的模拟肽学
  9.2.1环化技术
  9.2.2约束单元
  9.2.3环连接部件
  9.3约束氨基酸
  9.3.1 α?甲基化氨基酸
  9.3.2 α，α′?二烷基甘氨酸和α?氨基环烷羧酸
  9.3.3 Nα?Cα环化氨基酸
  9.3.4 Nα?甲基化氨基酸
  9.3.5 β?和γ?氨基环烷羧酸
  9.3.6 α，β?不饱和氨基酸
  9.3.7 β，β?二甲基和β?甲基氨基酸
  9.3.8 β?置换?2，3?亚甲基氨基酸
  9.3.9 N?Cδ和Cα?Cδ环化芳香氨基酸
  9.3.10 置换脯氨
  9.3.11 D?氨基酸
  9.4肽的二级结构的分子模拟
  9.4.1 β?转折
  9.4.1 γ?转折
  9.5非肽配体的设计
  9.6小结
  参考文献