计算机在分析生物学日益增长的海量数据方面起到了不可估量的作用,并推进了现代生物学的快速发展。本书详细介绍了一些重要生物学软件和数据库的使用,同时提供了一些实用的技巧和最新研究进展。全书分为五部分,包括序列分析软件包、分子生物学软件、网络信息资源、计算机和分子生物学的关系、生物信息学教学与最新文献跟踪。内容全面,实用性较强,可帮助生物信息学人员对该学科有更深入地了解。
本书可作为大专院校、科研机构的分子生物学、生物信息学等相关专业的研究生、科研和教学人员的参考书。
样章试读
目录
- 前言
编写成员
第一部分 序列分析软件包
1 GCG:序列分析程序威斯康星软件包
2 GCG序列分析程序基于网页的界面
3 Omiga:一种基于PC机的序列分析工具
4 MacVector:Macintosh计算机集成序列分析软件
5 DNASTAR的Lasergene序列分析软件
6 PepTool上标TM和GeneTool上标TM:非平台依赖性的生物序列分析工具
7 Staden软件包,1998
8 利用免费软件建立多用户序列分析系统
第二部分 分子生物学软件
9 Macintosh和MS Windows计算机分子生物学方面的免费软件
10 用FASTA3程序软件包进行灵活的序列相似性搜索
11 采用CLUSTAL W和CLUSTAL X进行多序列比对
12 用PHYLIP进行系统发生学分析
13 使用Genotator注释序列数据
14 低价位的凝胶分析系统
第三部分 网络信息资源
15 供临床遗传学者和分子遗传学者使用的计算机资源
16 NCBI网页上的公用工具和资源
17 EBI上的资源
18 计算机辅助分析转录调控区域:MatInspector和其他程序
19 计算机辅助的基因鉴定
20 万维网上适用于一般用户和生物学工作者的Primer3程序
21 利用万维网装备分子生物学实验室
第四部分 计算机和分子生物学:信息发布与限制
22 网络计算
23 利用DNA进行计算
24 检测生物模式:整合数据库、模型和算法
第五部分 生物信息学教学与最新文献跟踪
25 分子生物学和遗传学的计算机应用入门课程的设计与实施
26 虚拟图书馆Ⅰ:MEDLINE搜索
27 虚拟图书馆Ⅱ:科学引文索引和更新通告服务
28 虚拟图书馆Ⅲ:电子期刊、赠款、基金资助信息