根据现代遗传学的研究进展，已经将经典数量遗传学的多基因遗传体系拓展为主基因与多基因的混合遗传体系，纯为主基因、纯为多基因的遗传体系只是其特例。本书以这种混合遗传模式为理论基础，提出一套分析植物数量性状主基因+多基因遗传体系的分离分析方法。它将分离世代的分布看成是由主基因型确定的，受多基因和环境修饰的，多个正态分布的混合分布；采用了极大似然原理、IECM算法、AIC准则、适合性测验、最小二乘法和Bayes原理，建立起以个体和家系为单位的单个分离世代和多个世代联合的分离分析法，涉及的遗传模型可检测1～3对主基因、多基因和1～3对主基因加多基因。本书对经典数量遗传学的发展做了全面、深入的概括，在此基础上详细介绍了植物数量性状遗传分离分析法的主要理论、各种分离世代类型的公式推导和分析方法，并给出实例。此外，还探讨了该法的应用、应用中出现的问题，与分子标记法的比较，以及改进和发展的途径。最后，介绍了算法程序。为便于读者参考，尽量写成非数学性的形式。
样章试读
目录
- 《现代遗传学丛书》序
序
前言
第一章 引言
第一节 植物遗传改良与数量性状
第二节 植物育种性状的遗传体系与育种方法
第三节 数量性状遗传体系的检测方法和本书的目的与内容
第二章 植物数量性状遗传研究的发展
第一节 数量遗传学的形成与发展
第二节 植物数量遗传研究的主要内容及其在植物育种中的应用
一、植物数量遗传研究的主要内容
二、植物数量遗传理论在育种中的应用
第三节 植物数量性状遗传体系及其检测
一、关于植物数量性状遗传体系的认识
二、检测数量性状主基因+多基因混合遗传模型的研究
三、植物数量性状遗传体系主基因+多基因混合遗传模型分离分析方法
第三章 数量性状主基因-多基因遗传体系分离分析的遗传学基础
第一节 遗传模型及世代平均数的遗传组成
一、一对等位基因的加性-显性遗传模型
二、两对或多对基因的加性-显性遗传模型
三、势能比值
四、杂种自交世代及回交世代平均数的遗传组成
五、加性-显性遗传模型的适合性测验
第二节 加性-显性遗传模型下各世代的遗传方差组成
一、遗传方差组成的期望值
二、遗传方差组成的实验估计
三、狭义遗传率与显性程度
第三节 亲属间的协方差
一、F2：3家系对F2单株的协方差及回归
二、F4与F3世代间的协方差
第四节 有效因子数的估计
一、利用双亲差数的Castle-Wright公式及Mather公式
二、利用遗传方差的Panse公式
第五节 具有基因互作(上位性)效应的遗传模型
一、加性-显性-上位性遗传模型下世代平均数的组成
二、加性-显性-上位性遗传模型下世代方差和协方差的组成
三、连锁条件下的世代平均数与方差
第六节 分子标记与分离分析
第四章 数量性状分离分析法的混合分布理论
第一节 数量性状遗传体系的基本假定
一、经典数量遗传分析中的一些假定
二、数量性状遗传体系分离分析的主要遗传假定及其真实性分析
第二节 分离分析的混合分布理论
一、混合模型的研究历史
二、混合模型的应用
三、分离分析法中混合分布的一般理论
第三节 分离世代各种遗传体系的理论图形分析
一、主基因-多基因性状在F2世代的表型分布特征
二、主基因+多基因性状在回交世代和F2：3家系世代的表型分布特征
三、利用分离世代的图形分析初步鉴定数量性状的遗传体系
第四节 遗传数据与混合分布的相符性及数据变换
第五节 由实验数据估计分布参数——极大似然估计
一、极大似然估计的定义二、极大似然估计的统计性质
第六节 混合模型中参数极大似然估计的算法
一、EM算法
二、ECM算法
三、IECM算法
第七节 分离世代个体的后验概率
第五章 单个分离世代的数量性状分离分析
第一节 单个分离世代群体的遗传模型及其混合分布
一、F2群体的遗传模型及其混合分布
二、BC1F1的遗传模型及其混合分布
三、F2：3家系群体的遗传模型及其混合分布
四、回交衍生家系BC1F12群体的遗传模型及其混合分布
五、DH或RIL群体的遗传模型及其混合分布
第二节 单世代数量性状分离分析两步法
一、混合分布的样本似然函数和成分分布个数的估计
二、主基因+多基因混合遗传模型的遗传分析
第三节 单世代数量性状分离分析的一步法
一、主要步骤
二、极大似然估计的计算
三、家系重复试验资料的主基因+多基因混合遗传分析
四、由分布参数估计遗传参数的 方法
第四节 实例分析
一、利用单个分离世代检测数量性状遗传体系两步法应用举例
二、利用单个分离世代检测数量性状遗传体系一步法应用举例
第五节 单个分离世代与不分离世代的联合分析
一、单个分离世代的局限性及加进P1、P2和F1世代的增益
二、应用实例
第六章 多世代联合的数量性状分离分析Ⅰ——P1、F1、P2、F2和F2:3联合分析
第一节 遗传模型和各世代的混合分布
一、一对主基因遗传模型
二、两对主基因遗传模型
三、多基因遗传模型
四、一对主基因+多基因混合遗传模型
五、两对主基因+多基因混合遗传模型
第二节 似然函数中分布参数极大似然估计的计算
一、一对主基因遗传模型
二、两对主基因遗传模型
三、多基因遗传模型
四、一对主基因+多基因遗传模型
五、二对主基因+多基因遗传模型
第三节 实例分析
一、大豆对豆秆黑潜蝇抗性遗传的研究实例
二、大豆对食叶性害虫抗性发育的遗传研究实例
第七章 多世代联合的数量性状分离分析Ⅱ——P1、F1、P2、B1、B2和F2联合分析
第一节 遗传模型和各世代的混合分布
一、一对主基因遗传模型
二、两对主基因遗传模型
三、多基因遗传模型
四、一对主基因+多基因混合遗传模型
五、两对主基因+多基因混合遗传模型
第二节 似然函数中分布参数极大似然估计的计算
一、一对主基因遗传模型
二、两对主基因
三、多基因遗传模型
四、一对主基因+多基因混合遗传模型
五、两对主基因+多基因混合遗传模型
第三节 实例分析
一、 应用实例二、Monte Carlo模拟研究
第八章 六家系世代联合重复试验的数量性状分离分析——P1、F1、P2、B1:2、B2:2和F2:3联合分析
第一节 遗传模型和各世代的混合分布
一、一对主基因遗传模型
二、两对主基因遗传模型
三、多基因遗传模型
四、一对主基因+多基因混合遗传模型
五、两对主基因+多基因混合遗传模型
第二节 似然函数中分布参数的极大似然估计的计算
一、一对主基因遗传模型
二、两对主基因遗传模型
三、多基因遗传模型
四、一对主基因+多基因混合遗传模型
五、两对主基因+多基因混合遗传模型
第三节 实例分析
一、无重复试验的六家系世代联合的分离分析
二、有重复试验的六家系世代联合分离分析
第四节 数量性状分离分析中遗传参数标准误的估计
一、确定遗传参数估计值标准误的Jackknife法
二、确定遗传参数估计值标准误的Bootstrap抽样法
第九章 QTL遗传体系分离分析方法的应用
第一节 各种世代类型间分离分析方法的比较
一、各种世代类型的归纳
二、基本假定
三、遗传信息
四、精确度
第二节 植物数量性状遗传体系分离分析方法的应用
第三节 应用中发现的问题与改进途径
一、试验的精确度
二、分离比及其推论
三、单世代分离分析与多世代联合分离分析的一致性
四、分离分析法应用的扩展
五、遗传模型的命名体系
第四节 数量性状遗传体系分离分析法和分子标记法的比较与配合
一、在大豆上做的实验与比较
二、实验群体与理论群体相符性的检测与调整
第十章 数量性状分离分析的操作方法与算法程序
第一节 遗传试验设计与数据结构
一、遗传试验设计
二、试验数据的结构
三、数据文件的建立
第二节 分布参数估计与模型适合性测验
第三节 遗传参数估计
第四节 后验概率与主基因型归类
第五节 软件包的结构与使用
一、单个分离世代数量性状分离分析的算法程序
二、多个分离世代联合数量性状基因座遗传体系分析算法程序
参考文献
中文索引
英文索引
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