泛素家族包括近20种成员蛋白，其中泛素介导真核细胞内绝大多数蛋白质通过蛋白酶体进行选择性降解，类泛素蛋白ATG8/LC3则介导细胞自噬。细胞自噬通过溶酶体降解错误折叠蛋白、蛋白质聚集物和细胞器等细胞内物质。邱小波教授等10位学者于2008年共同编著了《泛素介导的蛋白质降解》（共8章）一书。该领域在过去10多年中取得了迅猛发展，已与生物学及医学研究的各个领域相互交叉。本书在此基础上进行拓展并增加了自噬的内容，以反映过去10多年来该领域的快速发展，系统而深入地介绍该领域的基本理论、实验技术及应用前景，共29章。
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第一章 泛素家族概论 1
第一节 泛素家族概述 1
第二节 泛素家族异常与人类疾病 4
第三节 溶酶体-自噬通路及其在蛋白质降解中的作用 5
第四节 泛素研究的背景与前景 7
第五节 小结 11
参考文献 11
第一篇 泛素-蛋白酶体通路
第二章 泛素化概论 15
第一节 泛素化的生物化学基础 15
第二节 泛素密码 25
第三节 泛素化修饰及其生物学功能 32
第四节 蛋白质翻译后修饰之间的对话 36
参考文献 40
第三章 泛素和类泛素激活酶 42
第一节 概述 42
第二节 泛素激活酶的表达和纯化 44
第三节 人类拟泛素激活酶APPBP1/UBA3异二聚体复合物的表达和纯化 44
第四节 激活酶UBE1L的表达和纯化 48
参考文献 49
第四章 泛素耦合酶 51
第一节 概述 51
第二节 泛素耦合酶UBC4/5家族的表达和纯化 55
第三节 泛素耦合酶Cdc34、UBC13和MMS2的表达及纯化 59
第四节 检测泛素耦合酶-泛素硫酯中间产物形成的高通量方法 63
参考文献 66
第五章 泛素连接酶 68
第一节 概述 68
第二节 实验技术 79
参考文献 137
第六章 泛素结合蛋白 140
第一节 泛素结合蛋白的特性和种类 141
第二节 泛素结合蛋白的功能 144
第三节 泛素结合蛋白与人类疾病 146
第四节 泛素结合结构域分析方法 147
参考文献 164
第七章 去泛素化酶 166
第一节 去泛素化酶的分类 166
第二节 去泛素化酶的作用机制 168
第三节 去泛素化酶的生理和病理功能 171
参考文献 173
第八章 相素化修饰 175
第一节 相素化修饰的生物学作用 175
第二节 相素化修饰及相关酶 177
第三节 相素化修饰相关基因敲除模型 181
第四节 相素化修饰与人类疾病 183
第五节 蛋白质相素化修饰分析方法 185
第六节 相素耦合酶UBC9的表达、纯化和活性鉴定 187
第七节 荧光共振能量转移方法分析相素化修饰 190
第八节 小结 195
参考文献 195
第九章 拟素化修饰 198
第一节 概述 198
第二节 拟素化修饰的蛋白底物 199
第三节 拟素化修饰与肿瘤 200
第四节 UBC12介导的拟素修饰实验 206
第五节 COP9信号体（CSN）的纯化 207
第六节 展望 224
参考文献 224
第十章 植物蛋白质的泛素化修饰 228
第一节 概述 228
第二节 植物体外泛素化检测修饰研究方法 231
第三节 植物体内快速高效检测蛋白泛素化修饰研究方法 238
参考文献 251
第十一章 植物蛋白质的相素化修饰 253
第一节 概述 253
第二节 实验技术 255
参考文献 260
第十二章 泛素化蛋白的质谱法鉴定 262
第一节 概述 262
第二节 泛素化蛋白的富集 264
第三节 泛素化蛋白的分离 271
第四节 泛素化蛋白的验证与定量 274
第五节 实验技术 277
参考文献 288
第十三章 泛素化修饰与表观遗传调控 290
第一节 概述 290
第二节 组蛋白泛素化的研究技术 292
第三节 组蛋白去泛素化的研究技术 294
参考文献 300
第十四章 泛素化修饰调控细胞代谢 302
第一节 泛素化修饰与糖代谢 302
第二节 泛素化修饰与脂质代谢 316
第三节 泛素化修饰调控氨基酸代谢 328
第四节 泛素化调控核酸代谢 336
第五节 代谢相关的信号通路与泛素化修饰 342
第六节 小结与展望 354
参考文献 355
第十五章 泛素化修饰与细胞周期调控 357
第一节 概述 357
第二节 细胞周期的泛素化修饰调控 361
第三节 泛素化修饰异常与人类疾病 378
第四节 实验技术 383
参考文献 388
第十六章 泛素化调节细胞死亡 389
第一节 细胞凋亡概述 389
第二节 细胞凋亡的调控 391
第三节 程序性坏死 408
第四节 泛素化调控决定细胞命运走向 409
第五节 凋亡检测方法 411
参考文献 415
第十七章 泛素化修饰调控固有免疫信号通路 418
第一节 泛素化修饰在TLR信号通路中的功能 418
第二节 泛素化修饰在RLR信号通路中的功能 422
第三节 泛素化修饰在NLR信号通路中的功能 427
第四节 泛素化修饰在STING依赖的信号通路中的功能 430
第五节 展望 432
参考文献 432
第十八章 蛋白酶体的结构与功能 435
第一节 蛋白酶体的组成与结构 435
第二节 蛋白酶体的作用机制 440
参考文献 447
第十九章 蛋白酶体的活性测定与纯化 449
第一节 蛋白酶体的活性测定 449
第二节 蛋白酶体及其激活物的纯化与分析 482
参考文献 496
第二十章 泛素-蛋白酶体通路与药物研发 498
第一节 概述 498
第二节 靶向泛素-蛋白酶体系统的小分子抑制剂 500
第三节 PROTAC技术 518
第四节 靶向泛素系统的药物研发策略 527
第五节 针对蛋白酶体的药物研发 533
第六节 展望 543
参考文献 544
第二篇 细胞自噬
第二十一章 细胞自噬概论 549
第一节 概述 549
第二节 自噬研究的历史 551
第三节 自噬的分子机制 554
第四节 自噬在生理学与疾病中的作用 564
参考文献 570
第二十二章 自噬的选择性 577
第一节 概述 577
第二节 与Atg8/LC3结合的受体蛋白 578
第三节 与Atg5结合的受体蛋白 585
第四节 分子伴侣介导的自噬的选择性降解 586
第五节 小结与展望 588
参考文献 588
第二十三章 泛素及类泛素信号对自噬的调控 592
第一节 类泛素蛋白介导自噬小体的形成及底物识别 592
第二节 泛素介导自噬受体构象改变和自噬受体复合物形成 594
第三节 泛素介导自噬小体形成和受体对底物的识别 596
第四节 泛素调控底物转运和自噬性降解 597
参考文献 599
第二十四章 蛋白聚集体自噬 601
第一节 概述 601
第二节 聚集体的形成、转运、识别和调控 602
第三节 聚集体自噬障碍与疾病 607
第四节 展望 611
参考文献 611
第二十五章 线粒体和细胞器自噬 614
第一节 线粒体和其他细胞器自噬 614
第二节 细胞器自噬的实验技术 622
参考文献 632
第二十六章 自噬与肿瘤 635
第一节 自噬抑制肿瘤的发生发展 635
第二节 自噬促进肿瘤发生发展的作用 637
第三节 自噬在肿瘤治疗中的应用 640
参考文献 642
第二十七章 酵母自噬研究方法 644
第一节 GFP-Atg8剪切实验 644
第二节 Pho8Δ60碱性磷酸酶实验 647
第三节 Ape1的成熟 649
第四节 Ape1的动力学研究 650
第五节 活细胞观察GFP-Atg8的循环周期 653
第六节 在atg1ts菌株中Atg9的运输 655
参考文献 657
第二十八章 线虫的自噬过程及分子机制 659
第一节 概述 659
第二节 线虫中的细胞自噬 659
第三节 线虫中的自噬实验技术 666
参考文献 672
第二十九章 自噬在临床的应用 675
第一节 自噬相关的药物分类 675
第二节 自噬相关药物作用的信号通路 682
第三节 自噬相关药物在临床的应用前景 689
参考文献 695
附录一 主要专业名词英汉对照 699
附录二 编委简介 707
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