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生物信息学实验


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生物信息学实验
  • 书号：9787030716897
    作者：陈铭,原春晖
  • 外文书名：
  • 装帧：平装
    开本：B5
  • 页数：130
    字数：172000
    语种：zh-Hans
  • 出版社：科学出版社
    出版时间：2022-03-01
  • 所属分类：
  • 定价： ￥29.80元
    售价： ￥23.54元
  • 图书介质:
    纸质书

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本书是《生物信息学》（科学出版社出版，陈铭主编）的配套实验教程，由浅入深，全面地介绍了生物信息学涉及的实验方法。全书共12个章节，涵盖了生物信息学需要掌握的基础计算机技术，如Linux系统、R语言的基本操作命令；以及数据库使用、序列比对、进化分析、基因预测、转录组分析、转录调控分析、单细胞转录组分析、蛋白质分析以及系统生物学相关的实验。每个章节先对实验进行简单介绍，然后通过案例进行操作步骤的详细介绍。
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    前言
    实验1 Linux系统入门与操作 1
    实验1-1 文件与目录管理 1
    实验1-2 文本输入 2
    实验1-3 系统管理 3
    实验1-4 Linux系统中的软件安装 6
    实验2 R语言基础 9
    实验2-1 R语言的基本操作 9
    实验2-2 使用R语言计算并安装R程序包 13
    实验2-3 使用R语言画图 15
    实验3 NCBI、ENA和DDBJ数据库的序列获取 20
    实验3-1 NCBI数据库序列数据的获取 20
    实验3-2 ENA数据库文件的下载 23
    实验3-3 使用DDBJ数据库下载测序数据 26
    实验4 双序列比对 29
    实验5 多序列比对分析 33
    实验6 进化分析 36
    实验7 基因预测 39
    实验7-1 基因翻译蛋白 39
    实验7-2 基因编码区预测 42
    实验8 转录组分析 44
    实验8-1 转录组数据准备 44
    实验8-2 质控 49
    实验8-3 序列映射 52
    实验8-4 转录本定量 54
    实验8-5 差异表达分析 58
    实验8-6 基因集功能富集分析 60
    实验8-7 加权基因共表达网络分析 65
    实验9 转录调控分析 73
    实验9-1 miRNA靶基因分析 73
    实验9-2 ceRNA调控分析 76
    实验10 单细胞转录组分析 78
    实验10-1 单细胞转录组数据矩阵的获取 78
    实验10-2 单细胞转录组数据的下游分析 80
    实验11 蛋白质分析 91
    实验11-1 蛋白质结构同源建模 91
    实验11-2 蛋白质结构可视化分析 94
    实验11-3 蛋白质?小分子的分子对接 97
    实验11-4 蛋白质组定量分析 106
    实验12 Cytoscape系统生物学 110
    参考文献 117
    附录1 思政小课堂 122
    附录2 常用软件介绍及下载 126
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