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芽胞杆菌·第五卷 芽胞杆菌基因组学


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芽胞杆菌·第五卷 芽胞杆菌基因组学
  • 书号：9787030757265
    作者：刘波等
  • 外文书名：
  • 装帧：圆脊精装
    开本：16
  • 页数：1484
    字数：2245000
    语种：zh-Hans
  • 出版社：科学出版社
    出版时间：2023-09-01
  • 所属分类：
  • 定价： ￥980.00元
    售价： ￥774.20元
  • 图书介质:
    纸质书

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“芽胞杆菌”系列丛书是基于科学研究的专业学术著作。本书是“芽胞杆菌”丛书的第五卷，共分为五章。第一章基因组测序技术的发展及其应用，综述了基因组测序技术的发展历史以及多种测序技术的原理和流程等，介绍了大规模的人类、动物和植物基因组计划的研究进展和成果。第二章主要生物类群的基因组研究进展，分别介绍了动物、植物和微生物的基因组研究进展，阐述了微生物基因组特征，介绍了几个重要的微生物组研究计划。第三章芽胞杆菌基因组测序进展，系统地总结了芽胞杆菌目的基因组测序进展，对每一种芽胞杆菌的所有菌株的基因组基本信息进行统计，包括菌株名称、测序机构、测序时间、组装水平和 GenBank登录号。第四章芽胞杆菌基因组分类学与系统发育分析，介绍了基因组分类学指标及其在芽胞杆菌分类学上的应用，分别进行了基于全基因组直系同源基因的属、科和目水平的系统发育分析。第五章芽胞杆菌基因组描述，对 671种芽胞杆菌的基因组进行了详细描述。书后列出了 2470余篇参考文献供读者查阅。
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    第一章基因组测序技术的发展及其应用 1
    第一节基因组测序技术的发展 1
    一、基因组测序技术发展历程中的关键事件 1
    二、早期的生物大分子测序技术 4
    三、第一代自动化 DNA测序技术 10
    四、第二代高通量 DNA测序技术 15
    五、第三代纳米孔单分子 DNA测序技术 30
    第二节基因组测序技术的应用与基因组研究计划 35
    一、概述 35
    二、人类基因组相关的研究计划与精准医学 36
    三、动物基因组研究计划 41
    四、植物基因组研究计划 44
    五、地球生物基因组计划 45
    第二章主要生物类群的基因组研究进展 47
    第一节基因组研究的两个发展时期 47
    一、基因组测序的缓慢发展期 47
    二、基因组测序的井喷式发展期 48
    第二节动物界基因组研究进展 49
    一、动物界的分类概况与基因组大小 49
    二、原生动物门的基因组测序 49
    三、中生动物门的基因组测序 51
    四、多孔动物门的基因组测序 52
    五、扁盘动物门的基因组测序 52
    六、刺胞动物门的基因组测序 52
    七、栉水母动物门的基因组测序 54
    八、扁形动物门的基因组测序 54
    九、纽形动物门的基因组测序 56
    十、轮虫动物门的基因组测序 56
    十一、腹毛动物门的基因组测序 56
    十二、线虫动物门的基因组测序 57
    十三、鳃曳动物门的基因组测序 59
    十四、内肛动物门的基因组测序 59
    十五、环节动物门的基因组测序 60
    十六、缓步动物门的基因组测序 60
    十七、有爪动物门的基因组测序 61
    十八、节肢动物门的基因组测序 61
    十九、软体动物门的基因组测序 69
    二十、腕足动物门的基因组测序 71
    二十一、帚虫动物门的基因组测序 71
    二十二、棘皮动物门的基因组测序 71
    二十三、半索动物门的基因组测序 72
    二十四、脊索动物门的基因组测序 73
    第三节植物界基因组测序进展 92
    一、种子植物门的分类概况 92
    二、裸子植物亚门的基因组测序 97
    三、双子叶植物纲或木兰纲的基因组测序 97
    四、单子叶植物纲或百合纲的基因组测序 106
    五、其他植物的基因组测序 109
    第四节微生物基因组的研究进展 111
    一、微生物基因组测序进展 111
    二、细菌基因组结构特点 114
    三、微生物的全基因组测序计划 120
    四、微生物组计划 122
    第三章芽胞杆菌基因组测序进展 133
    第一节芽胞杆菌基因组测序的基础信息 133
    第二节芽胞杆菌目各分类阶元的基因组测序进展 299
    一、科水平的基因组测序情况 299
    二、属水平的基因组测序情况 303
    三、蜡样芽胞杆菌群的基因组测序情况 305
    四、枯草芽胞杆菌群的基因组测序情况 307
    五、种水平的基因组测序情况 308
    第三节参与芽胞杆菌基因组测序的国家和机构 313
    一、参与芽胞杆菌基因组测序的国家 313
    二、参与芽胞杆菌基因组测序的机构 315
    三、进行了大量基因组重测序的机构 316
    四、特别关注某些特定种类基因组的机构 317
    第四节芽胞杆菌基因组测序在年份上的进展 317
    第五节芽胞杆菌基因组的拼接组装水平统计 318
    第四章芽胞杆菌基因组分类学与系统发育分析 320
    第一节细菌传统分类学与基因组分类学 320
    一、细菌分类学 320
    二、芽胞杆菌的多相分类学 321
    三、基因组分类学 324
    第二节芽胞杆菌基因组分类学研究 327
    一、基于基因组分类指标的芽胞杆菌新种鉴定 327
    二、基于全基因组的芽胞杆菌种类的重分类研究 331
    第三节基于全基因组直系同源基因的芽胞杆菌系统发育分析 334
    一、基于全基因组直系同源基因的芽胞杆菌科系统发育分析 334
    二、基于全基因组直系同源基因的脂环酸芽胞杆菌科系统发育分析 363
    三、基于全基因组直系同源基因的类芽胞杆菌科系统发育分析 366
    四、基于全基因组直系同源基因的显核菌科/动球菌科系统发育分析 376
    五、基于全基因组直系同源基因的嗜热放线菌科系统发育分析 385
    六、基于全基因组直系同源基因的芽胞杆菌目系统发育分析 386
    七、讨论 393
    第五章芽胞杆菌基因组描述 397
    第一节芽胞杆菌科基因组描述 397
    一、芽胞杆菌属 397
    二、好氧芽胞杆菌属 621
    三、碱芽胞杆菌属 622
    四、碱球菌属 623
    五、交替芽胞杆菌属 625
    六、兼性芽胞杆菌属 628
    七、居盐水芽胞杆菌属 630
    八、热碱芽胞杆菌属 631
    九、热芽胞杆菌属 632
    十、居热土菌属 634
    十一、房间芽胞杆菌属 635
    十二、假芽胞杆菌属 645
    十三、虚构芽胞杆菌属 647
    十四、地芽胞杆菌属 655
    十五、纤细芽胞杆菌属 670
    十六、喜盐碱芽胞杆菌属 681
    十七、喜盐芽胞杆菌属 682
    十八、盐乳杆菌属 695
    十九、解氢芽胞杆菌属 699
    二十、慢生芽胞杆菌属 700
    二十一、海洋芽胞杆菌属 707
    二十二、海洋球菌属 708
    二十三、高钠芽胞杆菌属 712
    二十四、大洋芽胞杆菌属 713
    二十五、鸟氨酸芽胞杆菌属 735
    二十六、副地芽胞杆菌属 739
    二十七、海境芽胞杆菌属 744
    二十八、少盐芽胞杆菌属 748
    二十九、海洋杆菌属 751
    三十、鱼芽胞杆菌属 752
    三十一、海芽胞杆菌属 754
    三十二、假纤细芽胞杆菌属 760
    三十三、类似芽胞杆菌属 762
    三十四、红发婴儿菌属 763
    三十五、盐小杆菌属 764
    三十六、盐微菌属 766
    三十七、盐渍芽胞杆菌属 772
    三十八、盐沼芽胞杆菌属 774
    三十九、居盐杆菌属 779
    四十、盐沉积物小杆菌属 781
    四十一、居盐土芽胞杆菌属 783
    四十二、栖盐水芽胞杆菌属 785
    四十三、沉积物芽胞杆菌属 787
    四十四、链喜盐芽胞杆菌属 791
    四十五、细纤芽胞杆菌属 792
    四十六、微温芽胞杆菌属 793
    四十七、土地芽胞杆菌属 795
    四十八、深海芽胞杆菌属 800
    四十九、枝芽胞杆菌属 802
    五十、火山芽胞杆菌属 823
    第二节脂环酸芽胞杆菌科基因组描述 824
    一、脂环酸芽胞杆菌属 824
    二、多变芽胞杆菌属 842
    三、科鲁比蒂斯氏菌属 845
    四、硫化芽胞杆菌属 847
    五、膨胀芽胞杆菌属 851
    第三节类芽胞杆菌科基因组描述 855
    一、嗜氨菌属 855
    二、解硫胺素芽胞杆菌属 857
    三、短芽胞杆菌属 864
    四、科恩氏菌属 882
    五、溪苔芽胞杆菌属 889
    六、大猩猩小杆菌属 891
    七、类芽胞杆菌属 894
    八、糖芽胞杆菌属 1042
    九、嗜热芽胞杆菌属 1044
    第四节巴斯德氏柄菌科基因组描述 1046
    巴斯德氏柄菌属 1046
    第五节动球菌科基因组描述 1047
    一、哈格瓦氏菌属 1047
    二、金黄微菌属 1051
    三、咸海鲜芽胞杆菌属 1052
    四、库特氏菌属 1059
    五、赖氨酸芽胞杆菌属 1066
    六、类芽胞束菌属 1096
    七、动球菌属 1099
    八、动微菌属 1116
    九、嗜冷芽胞杆菌属 1121
    十、鲁梅尔芽胞杆菌属 1124
    十一、土壤芽胞杆菌属 1127
    十二、芽胞束菌属 1131
    十三、尿素芽胞杆菌属 1139
    十四、绿芽胞杆菌属 1140
    第六节芽胞乳杆菌科基因组描述 1143
    一、垃圾芽胞杆菌属 1143
    二、中华球菌属 1144
    三、芽胞乳杆菌属 1145
    四、肿块芽胞杆菌属 1153
    第七节嗜热放线菌科基因组描述 1154
    一、芽胞链菌属 1154
    二、克罗彭施泰特氏菌属 1155
    三、莱西氏菌属 1158
    四、徐丽华菌属 1160
    五、海洋丝菌属 1162
    六、迈勒吉尔霉菌属 1164
    七、新建芽胞杆菌属 1167
    八、湿地丝菌属 1168
    九、平螺纹丝菌属 1169
    十、李城彬菌属 1172
    十一、制野氏菌属 1173
    十二、岛津氏菌属 1174
    十三、嗜热放线菌属 1176
    十四、嗜热黄微菌属 1178
    第八节未定科芽胞杆菌基因组描述 1181
    一、酸芽胞杆菌属 1181
    二、脱硫芽胞杆菌属 1183
    参考文献 1186
    附录芽胞杆菌系统分类纲要 1367
    第一节概述 1367
    一、已知的细菌和古菌门 1367
    二、厚壁菌门 1367
    三、芽胞杆菌纲 1368
    四、芽胞杆菌目 1368
    第二节脂环酸芽胞杆菌科分类纲要 1369
    一、脂环酸芽胞杆菌属（Alicyclobacillus Wisotzkey et al. 1992，gen. nov.） 1369
    二、多变芽胞杆菌属（Effusibacillus Watanabe et al. 2014，gen. nov.） 1371
    三、科鲁比蒂斯氏菌属（Kyrpidia Klenk et al. 2011，gen. nov.） 1371
    四、硫化芽胞杆菌属（ Sulfobacillus Golovacheva and Karavaiko 1991，gen. nov.） 1371
    五、膨胀芽胞杆菌属（Tumebacillus Steven et al. 2008，gen. nov.） 1372
    第三节芽胞杆菌科分类纲要 1372
    一、好氧芽胞杆菌属（ Aeribacillus Mi.ana-Galbis et al. 2010，gen. nov.） 1372
    二、艾丁芽胞杆菌属（Aidingibacillus Wang et al. 2018，gen. nov.） 1373
    三、异芽胞杆菌属（Aliibacillus Xu et al. 2018，gen. nov.） 1373
    四、碱芽胞杆菌属（Alkalibacillus Jeon et al. 2005，gen. nov.） 1373
    五、碱球菌属（Alkalicoccus Zhao et al. 2017，gen. nov.） 1373
    六、别样芽胞杆菌属（Allobacillus Sheu et al. 2011，gen. nov.） 1374
    七、交替芽胞杆菌属（Alteribacillus Didari et al. 2012，gen. nov.） 1374
    八、兼性芽胞杆菌属（Amphibacillus Niimura et al. 1990，gen. nov.） 1374
    九、厌氧芽胞杆菌属（Anaerobacillus Zavarzina et al. 2010，gen. nov.） 1375
    十、无氧芽胞杆菌属（Anoxybacillus Pikuta et al. 2000，gen. nov.） 1375
    十一、中盐芽胞杆菌属（Aquibacillus Amoozegar et al. 2014，gen. nov.） 1377
    十二、居盐水芽胞杆菌属（Aquisalibacillus Márquez et al. 2008，gen. nov.） 1377
    十三、金色芽胞杆菌属（Aureibacillus Liu et al. 2015，gen. nov.） 1377
    十四、芽胞杆菌属（Bacillus Cohn 1872，genus.） 1378
    十五、燃煤芽胞杆菌属（Calculibacillus Min et al. 2016，gen. nov.） 1400
    十六、热碱芽胞杆菌属（Caldalkalibacillus Xue et al. 2006，gen. nov.） 1400
    十七、热芽胞杆菌属（Caldibacillus Coorevits et al. 2012，gen. nov.） 1401
    十八、居热土菌属（Calditerricola Moriya et al. 2011，gen. nov.） 1401
    十九、樱桃样芽胞杆菌属（Cerasibacillus Nakamura et al. 2004，gen. nov.） 1401
    二十、堆肥芽胞杆菌属（Compostibacillus Yu et al. 2015，gen. nov.） 1401
    二十一、沙漠芽胞杆菌属（Desertibacillus Bhatt et al. 2017，gen. nov.） 1401
    二十二、房间芽胞杆菌属（Domibacillus Seiler et al. 2013，gen. nov.） 1402
    二十三、虚假芽胞杆菌属（Falsibacillus Zhou et al. 2009，gen. nov.） 1402
    二十四、发酵芽胞杆菌属（Fermentibacillus Hirota et al. 2016，gen. nov.） 1402
    二十五、虚构芽胞杆菌属（Fictibacillus Glaeser et al. 2013，gen. nov.） 1403
    二十六、线芽胞杆菌属（Filobacillus Schlesner et al. 2001，gen. nov.） 1403
    二十七、地芽胞杆菌属（Geobacillus Nazina et al. 2001，gen. nov.） 1404
    二十八、纤细芽胞杆菌属（Gracilibacillus Wain. et al. 1999，gen. nov.） 1405
    二十九、喜盐碱芽胞杆菌属（Halalkalibacillus Echigo et al. 2007，gen. nov.） 1407
    三十、喜盐芽胞杆菌属（Halobacillus Spring et al. 1996，gen. nov.） 1407
    三十一、盐乳杆菌属（Halolactibacillus Ishikawa et al. 2005，gen. nov.） 1408
    三十二、解氢芽胞杆菌属（Hydrogenibacillus K.mpfer et al. 2013，gen. nov.） 1409
    三十三、吉林芽胞杆菌属（Jilinibacillus Liu et al. 2015，gen. nov.） 1409
    三十四、慢生芽胞杆菌属（Lentibacillus Yoon et al. 2002，gen. nov.） 1409
    三十五、青螺芽胞杆菌属（Lottiidibacillus Liu et al. 2019，gen. nov.） 1410
    三十六、海洋芽胞杆菌属（Maribacillus Liu et al. 2019，gen. nov.） 1410
    三十七、海洋球菌属（Marinococcus Hao et al. 1985，gen. nov.） 1410
    三十八、马赛小杆菌属（Massilibacterium Tidjani Alou et al. 2016，gen. nov.） 1411
    三十九、迈勒吉尔芽胞杆菌属（Melghiribacillus Addou et al. 2015，gen. nov.） 1411
    四十、微好氧杆菌属（Microaerobacter Khelifi et al. 2011，gen. nov.） 1411
    四十一、高钠芽胞杆菌属（Natribacillus Echigo et al. 2012，gen. nov.） 1411
    四十二、嗜碱芽胞杆菌属（Natronobacillus Sorokin et al. 2009，gen. nov.） 1412
    四十三、努米底菌属（Numidum Tidjani Alou et al. 2016，gen. nov.） 1412
    四十四、大洋芽胞杆菌属（Oceanobacillus Lu et al. 2002，gen. nov.） 1412
    四十五、鸟氨酸芽胞杆菌属（Ornithinibacillus Mayr et al. 2006，gen. nov.） 1414
    四十六、副地芽胞杆菌属（ Parageobacillus Aliyu et al. 2019，gen. nov.） 1415
    四十七、海境芽胞杆菌属（Paraliobacillus Ishikawa et al. 2003，gen. nov.） 1415
    四十八、副碱芽胞杆菌属（Paralkalibacillus Hirota et al. 2017，gen. nov.） 1415
    四十九、少盐芽胞杆菌属（Paucisalibacillus Nunes et al. 2006，gen. nov.） 1416
    五十、海洋杆菌属（Pelagirhabdus Sultanpuram et al. 2016，gen. nov.） 1416
    五十一、鱼芽胞杆菌属（ Piscibacillus Tanasupawat et al. 2007，gen. nov.） 1416
    五十二、蓼芽胞杆菌属（Polygonibacillus Hirota et al. 2016，gen. nov.） 1416
    五十三、海芽胞杆菌属（Pontibacillus Lim et al. 2005，gen. nov.） 1416
    五十四、普氏菌属（Pradoshia Saha et al. 2019，gen. nov.） 1417
    五十五、假芽胞杆菌属（Pseudobacillus Verma et al. 2019，gen. nov.） 1417
    五十六、假纤细芽胞杆菌属（Pseudogracilibacillus Glaeser et al. 2014， gen. nov.） 1417
    五十七、普洱芽胞杆菌属（Pueribacillus Wang et al. 2018，gen. nov.） 1418
    五十八、类似芽胞杆菌属（Quasibacillus Verma et al. 2017，gen. nov.） 1418
    五十九、红发婴儿菌属（Rubeoparvulum Tidjani Alou et al. 2016，gen. nov.） 1418
    六十、糖球菌属（Saccharococcus Nystrand 1984，gen. nov.） 1418
    六十一、盐小杆菌属（Salibacterium Reddy et al. 2015，gen. nov.） 1418
    六十二、嗜盐杆菌属（Salicibibacter Jang et al. 2018，gen. nov.） 1419
    六十三、盐微菌属（Salimicrobium Yoon et al. 2007，gen. nov.） 1419
    六十四、盐渍芽胞杆菌属（ Salinibacillus Ren and Zhou 2005，gen. nov.） 1419
    六十五、盐沼芽胞杆菌属（Salipaludibacillus Sultanpuram and Mothe 2016， gen. nov.） 1420
    六十六、居盐杆菌属（Salirhabdus Albuquerque et al. 2007，gen. nov.） 1420
    六十七、盐沉积物小杆菌属（Salisediminibacterium Jiang et al. 2012，gen. nov.） 1420
    六十八、居盐土芽胞杆菌属（Saliterribacillus Amoozegar et al. 2013，gen. nov.） 1421
    六十九、栖盐水芽胞杆菌属（Salsuginibacillus Carrasco et al. 2007，gen. nov.） 1421
    七十、沉积物芽胞杆菌属（Sediminibacillus Carrasco et al. 2008，gen. nov.） 1421
    七十一、中华芽胞杆菌属（ Sinibacillus Yang and Zhou 2014，gen. nov.） 1421
    七十二、链喜盐芽胞杆菌属（Streptohalobacillus Wang et al. 2011，gen. nov.） 1422
    七十三、西南印度洋芽胞杆菌属（Swionibacillus Li et al. 2017，gen. nov.） 1422
    七十四、细纤芽胞杆菌属（ Tenuibacillus Ren and Zhou 2005，gen. nov.） 1422
    七十五、微温芽胞杆菌属（Tepidibacillus Slobodkina et al. 2014，gen. nov.） 1422
    七十六、土地芽胞杆菌属（Terribacillus An et al. 2007，gen. nov.） 1422
    七十七、德斯科科芽胞杆菌属（Texcoconibacillus Ruiz-Romero et al. 2013， gen. nov.） 1423
    七十八、深海芽胞杆菌属（Thalassobacillus García et al. 2005，gen. nov.） 1423
    七十九、深海杆菌属（Thalassorhabdus Sultanpuram and Mothe 2018，gen. nov.） 1423
    八十、高温长型芽胞杆菌属（Thermolongibacillus Cihan et al. 2014，gen. nov.） 1424
    八十一、枝芽胞杆菌属（Virgibacillus Heyndrickx et al. 1998，gen. nov.） 1424
    八十二、火山芽胞杆菌属（Vulcanibacillus L’Haridon et al. 2006，gen. nov.） 1426
    第四节类芽胞杆菌科分类纲要 1427
    一、氨芽胞杆菌属（Ammoniibacillus Sakai et al. 2015，gen. nov.） 1427
    二、嗜氨菌属（Ammoniphilus Zaitsev et al. 1998，gen. nov.） 1427
    三、解硫胺素芽胞杆菌属（ Aneurinibacillus Shida et al. 1996，gen. nov.） 1427
    四、短芽胞杆菌属（Brevibacillus Shida et al. 1996，gen. nov.） 1428
    五、曾呈奎菌属（Chengkuizengella Cao et al. 2017，gen. nov.） 1429
    六、科恩氏菌属（Cohnella K.mpfer et al. 2006，gen. nov.） 1430
    七、溪苔芽胞杆菌属（Fontibacillus Saha et al. 2010，gen. nov.） 1431
    八、大猩猩小杆菌属（Gorillibacterium Keita et al. 2017，gen. nov.） 1432
    九、长杆菌属（Longirhabdus Chen et al. 2019，gen. nov.） 1432
    十、海发菌属（Marinicrinis Guo et al. 2016，gen. nov.） 1432
    十一、食草酸菌属（Oxalophagus Collins et al. 1994，gen. nov.） 1432
    十二、类芽胞杆菌属（Paenibacillus Ash et al. 1994，gen. nov.） 1432
    十三、湿地杆菌属（Paludirhabdus Hwang et al. 2018，gen. nov.） 1449
    十四、糖芽胞杆菌属（Saccharibacillus Rivas et al. 2008，gen. nov.） 1449
    十五、嗜热芽胞杆菌属（Thermobacillus Touzel et al. 2000，gen. nov.） 1449
    十六、木聚糖芽胞杆菌属（ Xylanibacillus Kukolya et al. 2018，gen. nov.） 1450
    第五节巴斯德氏柄菌科分类纲要 1450
    巴斯德氏柄菌属（Pasteuria Metchnikoff 1888，genus.） 1450
    第六节显核菌科 /动球菌科分类纲要 1450
    一、哈格瓦氏菌属（Bhargavaea Manorama et al. 2009，gen. nov.） 1451
    二、显核菌属（Caryophanon Peshkoff 1939，genus.） 1451
    三、金黄微菌属（Chryseomicrobium Arora et al. 2011，gen. nov.） 1452
    四、土芽胞杆菌属（Edaphobacillus Lal et al. 2014，gen. nov.） 1452
    五、线杆菌属（Filibacter Maiden and Jones 1985，gen. nov.） 1452
    六、印度球菌属（Indiicoccus Pal et al. 2019，gen. nov.） 1452
    七、咸海鲜芽胞杆菌属（Jeotgalibacillus Yoon et al. 2001，gen. nov.） 1453
    八、库特氏菌属（Kurthia Trevisan 1885，genus.） 1453
    九、赖氨酸芽胞杆菌属（Lysinibacillus Ahmed et al. 2007，gen. nov.） 1454
    十、似赖氨酸芽胞杆菌属（Metalysinibacillus Gupta and Patel 2020，gen. nov.） 1456
    十一、似动球菌属（ Metaplanococcus Gupta and Patel，2020，gen. nov.） 1456
    十二、似土壤芽胞杆菌属（Metasolibacillus Gupta and Patel，2020，gen. nov.） 1456
    十三、类芽胞束菌属（Paenisporosarcina Krishnamurthi et al. 2009，gen. nov.） 1456
    十四、动球菌属（Planococcus Migula 1894，genus.） 1457
    十五、动微菌属（Planomicrobium Yoon et al. 2001，gen. nov.） 1458
    十六、嗜冷芽胞杆菌属（Psychrobacillus Krishnamurthi et al. 2011，gen. nov.） 1459
    十七、鲁梅尔芽胞杆菌属（Rummeliibacillus Vaishampayan et al. 2009，gen. nov.） 1459
    十八、萨维奇氏菌属（Savagea Whitehead et al. 2015，gen. nov.） 1460
    十九、土壤芽胞杆菌属（Solibacillus Krishnamurthi et al. 2009，gen. nov.） 1460
    二十、芽胞束菌属（Sporosarcina Kluyver and van Niel 1936，genus.） 1460
    二十一、特茨产胞菌属（Tetzosporium Tetz and Tetz 2018，gen. nov.） 1461
    二十二、尿素芽胞杆菌属（Ureibacillus Fortina et al. 2001，gen. nov.） 1461
    二十三、绿芽胞杆菌属（Viridibacillus Albert et al. 2007，gen. nov.） 1462
    第七节芽胞乳杆菌科分类纲要 1462 一、垃圾芽胞杆菌属（Caenibacillus Tsujimoto et al. 2016，gen. nov.） 1462 二、茶树芽胞杆菌属（Camelliibacillus Lin et al. 2018，gen. nov.） 1462 三、解支链淀粉芽胞杆菌属（Pullulanibacillus Hatayama et al. 2006，gen. nov.） 1463 四、火山渣芽胞杆菌属（Scopulibacillus Lee and Lee 2015，gen. nov.） 1463 五、中华球菌属（Sinobaca Li et al. 2008，gen. nov.） 1463 六、芽胞乳杆菌属（Sporolactobacillus Kitahara and Suzuki 1963，genus.） 1463 七、土壤乳杆菌属（Terrilactibacillus Prasirtsak et al. 2016，gen. nov.） 1464 八、肿块芽胞杆菌属（Tuberibacillus Hatayama et al. 2006，gen. nov.） 1464 第八节嗜热放线菌科分类纲要 1465 一、白氏菌属（Baia Guan et al. 2015，gen. nov.） 1465 二、黄丝菌属（Croceifilum Hatayama and Kuno 2015，gen. nov.） 1465 三、芽胞链菌属（Desmospora Yassin et al. 2009，gen. nov.） 1466 四、地热微菌属（Geothermomicrobium Zhou et al. 2014，gen. nov.） 1466 五、哈森氏菌属（Hazenella Buss et al. 2013，gen. nov.） 1466 六、克罗彭施泰特氏菌属（ Kroppenstedtia von Jan et al. 2011，gen. nov.） 1466 七、莱西氏菌属（Laceyella Yoon et al. 2005，gen. nov.） 1466 八、徐丽华菌属（Lihuaxuella Yu et al. 2013，gen. nov.） 1467 九、海洋丝菌属（Marininema Li et al. 2012，gen. nov.） 1467 十、嗜热海丝菌属（Marinithermofilum Zhang et al. 2015，gen. nov.） 1467
    十一、马尔克岛霉菌属（Mechercharimyces Matsuo et al. 2006，gen. nov.） 1467
    十二、迈勒吉尔霉菌属（Melghirimyces Addou et al. 2012，gen. nov.） 1468
    十三、新建芽胞杆菌属（Novibacillus Yang et al. 2015，gen. nov.） 1468
    十四、湿地丝菌属（Paludifilum Frikha-Dammak et al. 2016，gen. nov.） 1468
    十五、平螺纹丝菌属（Planifilum Hatayama et al. 2005，gen. nov.） 1468
    十六、多枝霉菌属（Polycladomyces Tsubouchi et al. 2013，gen. nov.） 1469
    十七、李城彬菌属（Risungbinella Kim et al. 2015，gen. nov.） 1469
    十八、盐丝菌属（Salinithrix Zarparvar et al. 2012，gen. nov.） 1469
    十九、制野氏菌属（Seinonella Yoon et al. 2005，gen. nov.） 1469
    二十、岛津氏菌属（Shimazuella Park et al. 2007，gen. nov.） 1469
    二十一、链孢菌属（Staphylospora Wang et al. 2019，gen. nov.） 1470
    二十二、嗜热放线菌属（Thermoactinomyces Tsilinsky 1899，genus.） 1470
    二十三、嗜热黄微菌属（Thermoflavimicrobium Yoon et al. 2005，gen. nov.） 1471
    第九节李斯特菌科分类纲要 1471
    一、环丝菌属（Brochothrix Sneath and Jones 1976，genus.） 1471
    二、李斯特菌属（Listeria Pirie 1940，genus.） 1471
    第十节葡萄球菌科分类纲要 1473
    一、深海球菌属（Abyssicoccus Jiang et al. 2016，gen. nov.） 1473
    二、别样球菌属（Aliicoccus Amoozegar et al. 2014，gen. nov.） 1473
    三、耳球菌属（Auricoccus Prakash et al. 2017，gen. nov.） 1473
    四、树皮球菌属（Corticicoccus Li et al. 2017，gen. nov.） 1473
    五、咸海鲜球菌属（Jeotgalicoccus Yoon et al. 2003，gen. nov.） 1473
    六、巨球菌属（Macrococcus Kloos et al. 1998，gen. nov.） 1474
    七、医院球菌属（Nosocomiicoccus Morais et al. 2008，gen. nov.） 1475
    八、盐球菌属（Salinicoccus Ventosa et al. 1990，gen. nov.） 1475
    九、葡萄球菌属（Staphylococcus Rosenbach 1884，genus.） 1476
    第十一节芽胞杆菌目科未定属分类纲要 1480
    一、酸芽胞杆菌属（Acidibacillus Holanda et al. 2015，gen. nov.） 1480
    二、碱乳芽胞杆菌属（ Alkalilactibacillus Schmidt et al. 2016，gen. nov.） 1481
    三、脱硫芽胞杆菌属（Desulfuribacillus Sorokin et al. 2014，gen. nov.） 1481
    四、微小杆菌属（Exiguobacterium Collins et al. 1984，gen. nov.） 1481
    五、孪生球菌属（Gemella Berger 1960，genus.） 1482
    六、地微菌属（Geomicrobium Echigo et al. 2010，gen. nov.） 1483
    七、能嗜热菌属（Thermicanus G..ner et al. 2000，gen. nov.） 1483
    第十二节讨论 1483
    一、芽胞杆菌目物种多样性 1483
    二、芽胞杆菌目形态多样性 1483
    三、芽胞杆菌目生境多样性 1484
    四、芽胞杆菌目应用领域广 1484
    五、芽胞杆菌目有害的种类 1484
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