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分子生物学是生命科学发展过程中诞生的一门实验性极强的新兴学科。美国著名分子生物学家Robert F. Weaver遵循这一学科发展的特点，于1999年出版了Molecular Biology一书。全书以原始研究论文为基础，通过对实验的设计、对结果的分析而逐步展开对分子生物学理论的讲述，文字通俗流畅，叙述由浅入深。随着学科的迅速发展，几经修订再版的《分子生物学》第五版共有导论，分子生物学方法，原核生物的转录，真核生物的转录，转录后加工，翻译，DNA复制、重组和转座，以及基因组等8个部分共25章的内容，书后还附有术语表。每一章节都以提出科学问题、展开研究过程开始，以提供思考习题、推荐阅读文献结束。

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  译者序
  序言
  致谢
  分子生物学实验技术目录
  第Ⅰ部分 导论
  第1章 分子生物学简史 1
  1.1 传递遗传学 1
  孟德尔的遗传定律 1
  遗传的染色体理论 2
  遗传重组和遗传定位 4
  重组的物理学证据 4
  1.2 分子遗传学 4
  DNA的发现 5
  基因和蛋白质之间的关系 5
  基因的行为 6
  1.3 生命的三个域 8
  第2章 基因的分子特性 11
  2.1 遗传物质的特性 11
  细菌转化 11
  多核苷酸的化学本质 14
  2.2 DNA结构 16
  实验背景 1 6
  双螺旋 l8
  2.3 RNA基因 20
  2.4 核酸的物理化学性质 20
  DNA结构的多样性 21
  不同大小和形状的DNA 24
  第3章 基因功能简介 28
  3.1 储存信息 28
  基因表达的总体过程 28
  蛋白质结构 29
  蛋白质功能 32
  信使RNA的发现 34
  转录 35
  翻译 37
  3.2 复制 42
  3.3 突变 42
  镰状细胞贫血病 42
  第Ⅱ部分 分子生物学方法
  第4章 分子克隆方法 46
  4.1 基因克隆 46
  限制性内切核酸酶的作用 47
  载体 49
  用特异性探针鉴定目的克隆 55
  cDNA克隆 56
  cDNA末端快速扩增 58
  4.2 聚合酶链反应 58
  标准PCR 58
  用反转录酶PCR进行cDNA克隆 60
  实时定量PCR 6l
  4.3 表达克隆基因的方法 61
  表达载体 62
  其他真核载体 68
  利用Ti质粒将基因导人植物 68
  第5章 研究基因和基因活性的分子工具 72
  5.1 分子的分离 72
  凝胶电泳 72
  双向凝胶电泳 75
  离子交换层析 76
  凝胶过滤层析 76
  亲和层析 77
  5.2 示踪标记 77
  放射自显影 78
  辚屏成像 79
  液体闪烁计数器 79
  非放射性尔踪 79
  5.3 核酸杂交的应用 80
  Southern印迹：鉴定特异DNA片段 80
  DNA指纹和DNA分型 81
  DNA指纹和DNA分型在法医学中的应用 82
  原位杂交：基因在染色体中的定位 84
  免疫印迹（Western印迹） 84
  5.4 DNA测序和物理图 85
  Sanger链末端终止测序法 85
  自动化DNA测序 87
  高通量测序 88
  限制图 90
  5 5 基于克隆基因的蛋白质工程：定点诱变 92
  5.6 图谱定位与转录物定量 94
  Northern印迹 94
  S1核酸酶作图 94
  引物延伸法 97
  截断转录和无G盒转录 98
  5.7 测定体内转录速率 99
  细胞核连缀转录 99
  报告基因转录 100
  测定体内蛋白质积累 101
  5 8 分析DNA蛋白质相与：作用 101
  滤膜结合 102
  凝胶阻滞 103
  DNA酶足迹 104
  DMS足迹法和其他足迹法 104
  染色质免疫沉淀( ChIP) l05
  5.9 蛋白质-蛋白质相互作用研究 107
  5.10 寻找与其他分子相互作用的RNA序列 108
  SELEX 108
  功能SELEX 109
  5.1l 基因敲除和转基因 109
  基因敲除小鼠 109
  转基因小鼠 112
  第Ⅲ部分 原核生物的转录
  第6章 细菌的转录机制 117
  6.1 RNA聚合酶的结构 117
  σ亚基是一种特异性因子 118
  6.2 启动子 118
  RNA聚合酶与启动子的结合 119
  启动子结构 121
  6.3 转录起始 122
  σ因子促进转录起始 123
  σ因子的再利用 124
  σ循环的随机模型 124
  启动子处DNA的局部解链 128
  启动子清除 130
  σ因子的结构和功能 134
  σ亚基在UP元件识别中的功能 138
  6.4 延伸 140
  核心酶在延伸过程中的作用 140
  延伸复合休的结构 142
  6.5 转录的终止 l00
  Rho非依赖型终止 151
  Rho依赖型终止 l54
  第7章 操纵子：细菌转录的精细调控 163
  7.1 lac操纵子 163
  lac操纵子的负调控 164
  操纵子的发现 166
  阻遏物与操纵基因问的相互作用 l68
  阻遏机制 169
  lac操纵子的正调控 173
  CAP的作用机制 174
  7.2 ara操纵子 178
  ara操纵子的阻遏环 178
  ara操纵子阻遏环的证据 179
  araC的自主调节 181
  7.3 trp操纵子 182
  色氨酸在trp操纵子负调控中的作用 l82
  衰减作用对trp操纵子的调控 183
  衰减作用的失效 184
  7.4 核糖开关 185
  第8章 细菌转录机制的主要转换模式 193
  8.1 σ因子的转换 193
  噬菌体感染 193
  孢子形成 195
  拥有多启动子的基因 197
  其他σ因子的转换 198
  抗σ因子 199
  8.2 T7噬菌体所编码的RNA聚合酶 199
  8.3 λ噬菌体对E.coli的感染 200
  λ噬菌体的裂解繁殖 201
  溶源态的建立 207
  溶源期cI基因的自我调节 209
  彼λ噬菌体感染后寄主命运的决定：裂解或溶源 213
  溶源菌的诱导 214
  第9章 细菌中DNA蛋白质的相互作用 219
  9.1 λ阻遏物家族 219
  利用定点突变探测结合的专一性 220
  λ阻遏物-操纵基因相互作用的高分辨率分析 225
  434噬菌体阻遏物操纵基因相互作用的高分辨率分析 228
  9.2 trp阻遏物 230
  色氨酸的作用 230
  9.3 对蛋白质DNA相互作用的一般性认识 231
  四个不同碱基对的氢键形成能力 231
  多聚DNA结合蛋白的重要性 232
  9.4 DNA结合蛋白：远程作用 232
  GZ操纵子 233
  重复的X操纵基因 233
  增强子 234
  第Ⅳ部分 真核生物的转录
  第10章 真核生物的RNA聚合酶及其启动子 240
  10.1 真核生物RNA聚合酶的多种形式 240
  三类细胞核聚合酶的分离 240
  三类RNA聚合酶的作用 24l
  RNA聚合酶亚基结构 244
  10.2 启动子 256
  Ⅱ类启动子 256
  I类启动子 260
  Ⅲ类启动子 261
  10.3 增强子与沉默子 265
  增强子 265
  沉默子 267
  第11章 真核生物中的通用转录因子 273
  11.1 Ⅱ类因子 273
  Ⅱ类预起始复合物 273
  TFIID的结构和功能 276
  TFIIB的结构和功能 287
  TFIIH的结构和功能 289
  中介物复合体和RNA聚合酶II全酶 296
  延伸因子 296
  11.2 I类因子 300
  核心结合因子 300
  UPE结合因子 301
  SL1的结构和功能 302
  11.3 Ⅲ类因子 304
  TFIIIA 304
  TFIIIB和TFIIIC 304
  TBP的作用 308
  第12章 真核生物的转录激活因子 316
  12.1 激活因子的类型 316
  DNA结合域 31 6
  转录激活域 317
  12.2 激活因子DNA结合模体的结构 317
  锌指结构 318
  GAL4蛋白 319
  细胞核受体 320
  同源异型域 322
  亮氨酸拉链和螺旋环螺旋域 323
  12.3 激活因子各功能域的独立性 325
  12.4 激活因子的功能 326
  TFIID的募集作用 326
  聚合酶全酶的募集 327
  12.5 激活因子问的相互作用 33l
  二聚化作用 33l
  远程作用 331
  转录工厂 336
  复合增强子 338
  结构转录因子 339
  增强体 340
  绝缘子 341
  12.6 转录因子的调控 346
  辅激活因子 346
  激活因子的泛素化 349
  激活因子的SUMO修饰 350
  激活因子的乙酰化 351
  信号转导途径 352
  第13章 染色质结构及其对基因转录的影响 359
  13.1 染色质结构 359
  组蛋白 359
  核小体 360
  30nm纤丝 363
  染色质折叠的更高级结构 366
  13.2 染色质结构与基因活性 367
  组蛋白对Ⅱ类基因转录的影响 367
  核小体定位 370
  组蛋白乙酰化 375
  组蛋白去乙酰化 377
  染色质重建 380
  异染色质与沉默 387
  核小体与转录的延伸 392
  第V部分 转录后加工
  第14章 RNA加工I：剪接 401
  14.1 断裂基因 401
  有关断裂基因的证据 402
  RNA剪接 403
  剪接信号 404
  剪接对基因表达的影响 405
  14.2 细胞核前体mRNA的剪接机制 406
  分支中间体 406
  分支点信号 408
  剪接体 409
  剪接体的组装及功能 420
  定向、剪接位点的选择及选择性剪接 424
  剪接的调控 435
  14.3 RNA的白剪接 438
  I型内含子 438
  Ⅱ型内含子 442
  第15章 RNA加工Ⅱ：加帽和多腺苷酸化 448
  15.1 加帽 448
  帽的结构 448
  帽的合成 450
  帽的功能 452
  15.2 多腺苷酸化 454
  poly (A) 454
  poly (A)的功能 455
  多腺苷酸化的基本机制 457
  多腺苷酸化信号 458
  前体mRNA的剪切和多腺苷酸化 461
  poly (A)聚合酶 468
  poly (A)的更新 468
  15.3 mRNA加上事件的协同运作 470
  Rpbl的CTD与mRNA加T蛋白的
  结合 470
  RNA如T蛋白与CTD结合的变化与
  CTD磷酸化相关 471
  存在一个CTD密码？ 473
  转录终止与mRNA 3’端加工的偶联 476
  终止的机制 477
  多腺苷酸尾在mRNA转运中的作用 480
  第16章 其他RNA加工事件及基因表达的转录后调控 486
  16.1 核糖休RNA的加工 486
  真核生物rRNA的加工 486
  细菌rRNA的加工 489
  16.2 转运RNA的加工 490
  切开多顺反子前体物 490
  成熟5’端的形成 490
  成熟3’端的形成 49l
  16.3 反式剪接 492
  反式剪接机制 492
  16.4 RNA编辑 494
  编辑的机制 495
  核苷酸去氨基化编辑 498
  16.5 基因表达的转录后渊控：mRNA稳定性 499
  酪蛋白mRNA的稳定性 499
  转铁蛋白受体mRNA的稳定性 500
  16.6 基因表达的转录后调控：RNA干扰 505
  RNAi的机制 505
  siRNA的扩增 512
  RNAi杌制在异染色质形成和芳同论的中的作用 512
  16.7 Piwi互作RNA与转座子调控 518
  16.8 基因表达的转录后调控：microRNA 520
  miRNA引起的翻译沉默 520
  miRNA引起的翻译激活 525
  16.9 翻译的抑制、mRNA降解及P-体 529
  P体（加工体） 529
  P-体中的mRNA降解 529
  P体中的抑制解除 532
  其他小RNA 536
  第Ⅵ部分 翻译
  第17章 翻译机制I：起始 543
  17.1 细菌中翻译的起始 543
  tRNA负载 543
  核糖体的解离 544
  30S起始复合物的形成 546
  70S起始复合物的形成 552
  细芮中的翻译起始总结 553
  17.2 真核生物翻译的起始 554
  起始的扫描模型 554
  真核生物的起始因子 558
  17.3 翻译起始的调控 566
  细菌的翻译调控 566
  真核生物的翻译调控 570
  第18章 翻译机制Ⅱ：延伸与终止 583
  18.1 多肽链合成及mRNA翻译的方向 583
  18.2 遗传密码子 584
  非重叠性密码子 584
  密码中无间隔 585
  三联密码 586
  破译密码 587
  密码子与反密码子间的异常碱基配对 588
  （几乎）通用的密码 590
  18.3 延伸机制 591
  延伸概述 591
  核糖体的3-位点模型 593
  延伸步骤2：肽键的形成 601
  延伸步骤3：移位 603
  G蛋白和翻译 606
  EF-Tu和EF-G的结构 607
  18.4 终止 608
  终止密码子 608
  终止密码子的抑制 610
  释放因子 611
  异常终止的处理 612
  18.5 翻译后 617
  新生蛋白质的折叠 617
  核糖体从mRNA的释放 619
  第19章 核糖体和转运RNA 627
  19.1 核糖体 627
  70S核糖体的精细结构 627
  核糖体的组成 631
  30S亚基的精细结构 632
  50s亚基的精细结构 637
  核糖体结构与翻译的机制 64l
  多聚核糖体 647
  19.2 转运RNA 648
  tRNA的发现 648
  tRNA的结构 649
  第Ⅶ部分 DNA复制、重组和转座
  第20章 DNA复制、损伤与修复 662
  20.1 DNA复制的一般特征 662
  半保留复制 662
  至少是半不连续复制 664
  DNA合成的引发 667
  双向复制 668
  滚环复制 671
  20.2 DNA复制的酶学 672
  E.coli的三种DNA聚合酶 672
  复制的忠实性 676
  真核生物的多种DNA聚合酶 676
  链的解离 677
  单链DNA结合蛋白 678
  拓扑异构酶 679
  20.3 DNA损伤与修复 683
  紫外线辐射引起的DNA损伤 684
  γ射线及X射线引起的DNA损伤 684
  直接消除DNA损伤 685
  切除修复 686
  真核生物的双链断裂修复 691
  错配修复 694
  人类细胞错配修复系统的失效 695
  DNA损伤的非修复处理 695
  第21章 DNA复制Ⅱ：详细机制 706
  21.1 复制的起始 706
  E.coli的DNA复制引发 706
  真核生物DNA复制的引发 708
  21.2 延伸 712
  复制的速度 712
  PolⅢ全酶与复制的持续性 713
  21.3 复制的终止 723
  解连环：解开子代DNA 723
  真核生物DNA复制的终止 724
  第22章 同源重组 739
  22.1 同源重组的RccBCD途径 739
  22.2 RecBCD途径的实验证据 741
  RccA 74l
  RecBCD 745
  RuvA和RuvB 746
  RuvC 700
  22.3 减数分裂重组 70l
  减数分裂重组的机制：综述 751
  双链DNA断裂 752
  DSB处单链末端的生成 757
  22.4 基因转换 758
  第23章 转座 762
  23.1 细菌转胚子 762
  细菌转座子的发现 762
  插入序列：最简单的细菌转座子 763
  更复杂的转座子 764
  转座的机制 764
  23.2 真核生物的转座子 766
  P元件 768
  23.3 免疫球蛋白基因的重排 769
  重组信号 771
  重组酶 772
  V (D)J重组机制 773
  23.4 反转录转座子 774
  反转录病毒 775
  反转录转座子 778
  第Ⅷ部分 基因组
  第24章 基因组学I:全基因组测序 788
  24.1 图位克隆：基因组学介绍 788
  图位克隆的传统手段 788
  鉴定与人类疾病相关的突变基因 791
  24.2 基因组测序技术 794
  人类基因组计划 797
  用于大规模基因组计划的载体 797
  逐步克隆策略 798
  鸟枪法测序 802
  测序的标准 803
  24.3 基因组测序的研究和比较 803
  人类基因组测序 803
  个体基因组学 807
  其他脊椎动物基因组 808
  最小的基因组 811
  生命条形码 813
  第25章 基因组学Ⅱ：功能基因组学、蛋白质组学和生物信息学 818
  25.1 功能基因组学：基因组的基因表达 818
  转录组学 819
  基因组功能图表 828
  单核苷酸多态性：药物基因组学 839
  25.2 蛋白质组学 84l
  蛋白质分离 842
  蛋白质分析 842
  定量蛋白质组学 843
  蛋白质的相互作用 845
  25.3 生物信息学 849
  从哺乳动物基因组中发现调控基序 849
  学会使用数据库 851
  分子生物学专业词汇表 857
  索引
  教师反馈表